DMU udfører den økologiske risikovurdering af alle genmodificerede planter som udsættes i forsøg eller som søges markedsført i Danmark og EU. DMU's forskning giver grundlag for beskyttelsen af naturen og for fastsættelsen af sikkerhedsafstande mellem genmodificerede og økologiske afgrøder.

DMU udfører miljømæssige risikovurderinger af gensplejsede mikroorganismer (indesluttet anvendelse og udsætning) og mikrobielle plantebeskyttelsesmidler og medvirker til udviklingen af bioteknologiske løsninger på miljøproblemer, f.eks. jordrensning vha. mikroorganismer og planter.