Op mod en tredjedel af alle dødsfald i verden skyldes infektionssygdomme, og på verdensplan er der i de senere år sket en eksplosiv stigning i antallet af sygdomstilfælde forårsaget af mikroorganismer (specielt bakterier og vira). Bakteriers evne til at forårsage infektionssygdomme hos dyr og mennesker beror på deres virulens- eller sygdomsfremkaldende gener. Forskning i bakteriers genetiske struktur har vist, at mange af disse gener også findes hos en lang række ikke-sygdomsfremkaldende miljøbakterier. Det antages derfor, at generne er afgørende for bakteriernes overlevelse og aktivitet i naturen, mens dyr og mennesket i den sammenhæng blot er en blandt flere potentielle økologiske nicher. Der er også tilfælde, hvor de patogene organismer overlever i hidtil ukendte eller oversete nicher i naturen imellem infektion af såvel dyr som mennesker.

Der er et stort behov for viden omkring mikroorganismers ”naturhistorie” - dvs. deres autøkologi, nicheudnyttelse og interaktioner på tværs af trofiske niveauer. En sådan viden vil være af central betydning for vores forståelse af de mekanismer, som ligger bag udvikling og spredning af infektionssygdomme hos dyr og mennesker.

Målet med dette prioriterede område er at etablere og udvikle et krydsfelt mellem (molekylær) mikrobiel økologi og medicinsk mikrobiologi med henblik på at undersøge betydningen af miljøet som levested (reservoir) og eventuelt ”fitness center” for patogene mikroorganismer. Specifikt er det målet at

• undersøge forekomst af patogene egenskaber i miljøet, herunder udvikle metoder til dyrkning af ”hard-to-culture” bakterier med henblik på at identificere og isolere nye potentielle opportunistiske patogener
• undersøge den genetiske variation og evolution af patogene egenskaber i miljøet
• undersøge funktion af patogener i miljøet, herunder studier af interaktioner mellem patogener og mikro-, meso- og makrofauna (og evt. planter)
• undersøge spredning af patogene mikroorganismer og egenskaber i miljøet herunder specielt luftbåren spredning

Igangværende projekter omfatter blandt andet:

Forekomst og karakterisering af virulensgener i miljøet. I projektet undersøges hyppigheden af diverse virulensfaktorer i naturlige miljøer (forskellige jordtyper, søvand) og det undersøges i hvor stor udstrækning naturlige jordbakterier besidder og udtrykker sygdomsfremkaldende egenskaber. Kontaktperson: Niels Kroer

Center for Vildtsundhed er et samarbejde mellem Naturstyrelsen, Veterinærinstituttet ved DTU og DMU. I centret arbejdes med danske vilde dyrs sundhed. Indtil videre har arbejdet i Afdelingen fokuseret på forekomst af patogene Campylobacter spp. i syge rådyr samt samspillet mellem ederfugle og Pasteurella multocida som forårsager fuglekolera.
Kontaktperson: Anne Winding

Forekomst af B. cereus gruppe bakterier på grøntsager fra såvel væksthuse som friland. Med udgangspunkt i resultaterne forsøges det at etablere en forklaringsmodel for forekomsten. Desuden karakteriseres de isolerede bakterier med hensyn til forekomst af potentielle patogene egenskaber og hvorvidt bakterierne udtrykker disse gener (dvs har effekter in vitro på humane cellelinier). Kontaktperson: Niels Bohse Hendriksen

Identifikation af B. cereus gruppe bakterier, som besidder egenskaber karakteristiske for B. anthracis (miltbrand-bakterien). Fra jord, grøntsager og luft identificeres bakterier, som besidder homologier med gener karakteristiske for B. anthracis, og som er involveret i dens patogenicitet. Sådanne bakterier er relativt almindeligt forekommende i de undersøgte miljøer og analyseres nærmere for deres slægtskabsmæssige relationer til B. anthracis. Kontaktperson: Niels Bohse Hendriksen

Undersøgelser af forekomst af bakterier i skyer. Forskningen omfatter undersøgelser af  den mikrobiel diversitet, aktivitet og funktion samt forekomst af bakterier med patogene egenskaber. Denne viden vil bidrage til forståelse af mikrobiel økologi i skyer, hvilket har betydning for monitering af bioterror-mikroorganismer. Kontaktpersoner: Ulrich Bay Gosewinkel

 Luftprøvetagnings-udstyr sat på en Piper 28

Her kan du kan læse mere om igangværende projekter og arbejdsprogrammet for 2010